船舶所有权登记，指将船舶所有权各种变动的事实依法定程序记载在国家专门机关制作的专门簿册上的事实或行为。要分清船舶所有物变动与船舶所有权登记的关系，首先应该区分不同船舶所有权变动模式，船舶所有权变动模式是讨论二者之间关系的前提条件。因为不同的船舶所有权变动模式有着不同的登记效力，对登记也有着不同的要求。我国《海商法》将登记作为船舶所有权变动的公示方法，采用登记对抗效力模式，所以应当在船舶所有权登记对抗模式下讨论船舶所有权变动和船舶所有权登记的关系。在这种登记效力下，船舶所有权登记的作用是将发生在当事人之间的船舶所有权变动通过登记显示于外，成为他人得知的媒介，增强船舶所有权的外部效力。
船舶所有权变动和船舶所有权登记的关系首先体现在船舶所有权登记不是船舶所有权变动的必要条件。我国船舶所有权的变动并没有像《物权法》中对不动产的规定那样，即:不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力;未经登记，不发生效力。而是属于《物权法》第九条规定中的“但法律另有规定的除外”的例外规定情形，具体规定在第24条中。也就是船舶所有权的变动不需要登记就发生变动效力，登记与否并不影响船舶所有权在买卖双方之间的变动。因此，船舶所有权登记不是船舶所有权变动的必要条件。如果不进行登记，船舶买卖双方当事人依然能发生船舶所有权的转移。船舶所有权登记只不过是起到更好的保障作用。
其次，船舶所有权变动后，法律并不强制规定船舶所有权人必须进行登记，也就是说登记不是一种法律的强制要求。在登记生效模式下，要想物权发生变动，当事人必须进行法律规定的登记，否则是不产生法律效力的。而在登记对抗主义模式下，登记与否影响的只是物权的保护程度，并不影响物权变动，法律并不强制权利人进行物权登记。登记是船舶所有权人自由选择的一项权利，而不是一项法律义务。
通过上述分析，我们可以看到，我国船舶所有权变动是船舶所有权登记的前提，没有船舶所有权变动就没有船舶所有权登记，只有取得了船舶所有权，才可以进行船舶所有权登记。而且申请登记是船舶所有权人一种自愿的、任意的行为，也是法律予以保护的权利，不是法定义务。
